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表3在塑性基因组之间编辑​​的比较S. Ventgaris.KRA和S. Ventgaris.KOV和8种Agiosperm种类。ambo.。-Amborella trichopoda.螺旋。-Spirodela polyrhiza.Aegilops Tauschii.阿拉伯。-拟南芥蒂利亚纳Hevea Brasiliensis.妮特。-尼科尼亚塔哈瓦姆Vigna Radiata.Cucumis sativus

从:牙型物种中塑性基因组的变异Silene Vulgaris.

基因组
位置
编辑率 基因组
位置
编辑率 ambo。 螺旋。 Aegilops. 阿拉伯。 Hevea. 妮特。 Vigna. cucumis.
基因位置 效果/备注 克拉 KOV.
RPS 16内含子 5004. 69% 4996. 30% NA. NA. NA. NA. C NA. NA. NA.
RPS 16内含子 5325. 93% 5317. 93% T. C 编辑 T. C C? C? C?
Atpaeu914SL. TCA(S)=> TTA(L) 10,003 96% 10,000 96% 编辑 T. T. T. T. T. T. T.
代际 12,532 92% 12,531 93% NA. NA. NA. NA. NA. NA. NA. NA.
代际 13,336 50% 13,336 72% NA. NA. NA. NA. NA. NA. NA. NA.
RPS2EU248SL. TCA(S)=> TTA(L) 14,920 98% 14,920 97% C T. T. T. 编辑 C 编辑 编辑
RPOC2EU2968HY. 猫(h)=> tat(y) 16,608 70% 16,586 85% C T. C T. C C C C
RPOBEU566SL TCG(S)=> TTG(L) 25,178 52% 25,156 80% C T. 编辑 T. T. T. 编辑 编辑
RPOBEU551SL. TCA(S)=> TTA(L) 25,193 49% 25,171 76% 编辑 T. 编辑 编辑 编辑 编辑 编辑 编辑
RPOBEU473SL. TCA(S)=> TTA(L) 25,271 78% 25,249 83% 编辑 编辑 编辑 T. T. 编辑 T. T.
psbzeu50sl. TCA(S)=> TTA(L) 34,009 0. 33,958 6% C 编辑 C 编辑 C T. T. C
RPS14EU80SL. TCA(S)=> TTA(L) 35,133 98% 35,071 96% T. T. T. 编辑 编辑 编辑 编辑 T.
ndhjeu160qx. CAA(Q)=> TAA(停止) 47,529 13% 47,486 8% C C C C C C C C
代际 47,740. 32% 47,697 45% NA. NA. NA. NA. NA. NA. NA. NA.
ndhkeu65sl. TCA(S)=> TTA(L) 48,408 65% 48,365 77% 编辑 T. 编辑 T. 编辑 T. T. 编辑
代际 49,285 23% 49,243 43% NA. NA. NA. NA. NA. NA. NA. NA.
ACCDEU1337PL CCA(P)=> CTA(L) 57,221 95% 57,185 96% 编辑 T. T. C)B. T. T. T. T.
psaieu85hy. 猫(h)=> tat(y) 57,642 71% 57,601 82% 编辑 T. T. C T. C 编辑 编辑
psbleu2tm. ACG(T)=> ATG(开始) 62,667 96% 62,630. 98% 编辑 T. T. T. T. 编辑 T. T.
Petleu5pl. CCT(P)=> CTT(L) 64,268 86% 64,236 90% 编辑 T. T. 编辑 编辑 T. 编辑 T.
代际 64,933 83% 64,902 86% NA. NA. NA. NA. NA. NA. NA. NA.
clppeu559hy. 猫(h)=> tat(y) 68,351 97% 68,321. 98% 编辑 T. T. 编辑 编辑 T. 编辑 编辑
petbeu12vv. 静音GTC(v)=> gtt(v) 73,958 32% 73,935 56% 一种 C 一种 T. C 一种 T. G
petbeu418rw. Cgg(r)=> tgg(w) 74,364 97% 74,341 93% 编辑 T. T. T. T. T. T. 编辑
RPOAEU200SF. TCT(S)=> TTT(F) 77,018 93% 76,983 89% 编辑 编辑 T. 编辑 编辑 C 编辑 C
ndhbeu1481pl. CCA(P)=> CTA(L) 91,996. 89% 91,961 80% 编辑 编辑 编辑 编辑 编辑 编辑 编辑 编辑
ndhbeu836sl. TCA(S)=> TTA(L) 92,641. 90% 92,606. 88% T. 编辑 编辑 编辑 C 编辑 编辑 C
ndhbeu830sl. TCA(S)=> TTA(L) 92,647 88% 92,612 84% 编辑 编辑 编辑 编辑 编辑 编辑 编辑 编辑
ndhbeu746sf. TCT(S)=> TTT(F) 93,399 74% 93,364. 80% T. T. T. 编辑 编辑 编辑 编辑 C
ndhbeu737pl. CCA(P)=> CTA(L) 93,408 87% 93,373 81% 编辑 编辑 编辑 T. T. 编辑 编辑 编辑
ndhbeu586hy. 猫(h)=> tat(y) 93,559. 60% 93,524 56% 编辑 编辑 编辑 编辑 编辑 编辑 编辑 编辑
ndhbeu542tm. ACG(T)=> ATG(M) 93,603 30% 93,568 45% 编辑 编辑 T. T. 编辑 T. 编辑 编辑
ndhbeu467pl. CCA(P)=> CTA(L) 93,678 73% 93,643 79% 编辑 编辑 编辑 编辑 编辑 编辑 T. 编辑
ndhbeu149sl. TCA(S)=> TTA(L) 93,996 58% 93,961 69% 编辑 编辑 编辑 编辑 编辑 编辑 编辑 编辑
ndhdeu1298sl. TCA(S)=> TTA(L) 113,839. 96% 113,810 96% T. T. T. T. T. C T. T.
ndhdeu887pl. CCC(P)=> CTC(L) 114,250 84% 114,221 87% T. T. T. 编辑 编辑 T. T. 编辑
ndhdeu383hy. 猫(h)=> tat(y) 114,754 78% 114,722 87% 编辑 T. T. 编辑 T. 编辑 编辑 编辑
ndhdeu2tm. ACG(T)=> ATG(开始) 115,135 13% 115,103 16% 编辑 编辑 T. 编辑 T. 编辑 编辑 编辑
ndhgeu50ti. ACA(T)=> ATA(i) 116,860. 78% 116,828 86% C T. T. 编辑 T. C)C C)D. 编辑
ndhaeu1073sf. TCC(S)=> TTC(F) 117,937 83% 117,905 75% 编辑 编辑 编辑 T. T. 编辑 编辑 T.
ndhaeu961ps CCT(P)=> TCT 118,049 74% 118,017 83% 编辑 编辑 T. T. 编辑 编辑 T. T.
ndhaeu5666sl. TCA(S)=> TTA(L) 118,444. 6% 118,412 21% 编辑 编辑 编辑 T. 编辑 T. T. 编辑
ndhaeu341sl. TCA(S)=> TTA(L) 119,692 89% 119,660. 73% T. T. T. 编辑 C 编辑 编辑 编辑
ndhheu303ii. 沉默的ATC(i)=> att(i) 120,913 29% 120,881 7% C C T. C C C C C
编辑以下阈值)一种
psaieu82lf. CTT(L)=> TTT(F) 57,639 5% 57,598 4% C C C C C C C C
代际 57,712 9% 57,671 15% NA. NA. NA. NA. NA. NA. NA. NA.
代际 57,717. 7% 57,676 12% NA. NA. NA. NA. NA. NA. NA. NA.
代际 57,740. 4% 57,699 9% NA. NA. NA. NA. NA. NA. NA. NA.
代际 57,745 5% 57,704 9% NA. NA. NA. NA. NA. NA. NA. NA.
代际 57,892 4% 57,854. 8% NA. NA. NA. NA. NA. NA. NA. NA.
代际 57,897 2% 57,859 13% NA. NA. NA. NA. NA. NA. NA. NA.
  1. C?有关编辑不可用的信息
  2. 一种)编辑率在大多数植物中没有达到阈值(使用GSNAP或氯化物),
  3. 但是在所有12个人中观察到的编辑活动S.Vulgari.ko和kra
  4. B.GCA三联体in.拟南芥编码丙氨酸
  5. CTCG三联体in.尼古利亚娜编码丝氨酸
  6. D.TCA三联体内Vigna.编码丝氨酸