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表1尾部和通用探针(UPS)的序列和基因特异性引物(GSP)的实例,用于扩增荧光样SNP标记

从:植物基因分型KASP上的放大器样SNP标记的优点

姓名 序列(5'-3')
A.尾巴
尾巴1-(FAM) 高纳Gaccaag.Ttcatgct.
尾部2-(六角/维基) 高纳Cggagtc.Aacggatt.
尾巴3-(FAM) GTtcatgct.
尾部4-(六角/ vic) GAacggatt.
B.普遍探针(UPS)
UP-1(FAM) FAM-AGCGATGCGTTCGAGCATCGC.(t *)GaAGGTGACCAAGTTCATGCT.
UP-2(十六进制/ VIC) HEX / VIC-AGGACGCTGAGATGCGTCC(t *)GaAGGTCGGAGTCAACGATT.
UP-3(FAM) FAM-AGCGATGCGTTCGAGCATCGC.(t *)gttcatgct.
UP-4(十六进制/ VIC) HEX / VIC-AGGACGCTGAGATGCGTCC(t *)Gaacggatt.
C.基因特异性引物(大麦Katu37,Contig ABC08184)
katu37-f1 GaAGGTGACCAAGTTCATGCT.attgagcgattacgacgagc.
katu37-f2 GaAGGTCGGAGTCAACGATT.attgagcgattacgacgaga.
Katu37-R. gcaaggacaagacaggcag.
katu37-f3 gttcatgct.attgagcgattacgacgagc.
katu37-f4 Gaacggatt.attgagcgattacgacgaga.
Katu37-R. gcaaggacaagacaggcag.
  1. 在两对尾部,相同的序列用正常情况或斜体下划线。在UPS和GSP中,尾部以斜体显示。在UPS中,荧光团位于5'-末端,胸苷(T)串联表示用猝灭剂BHQ-1改性的位置。从先前公布的材料中提取数据[10.11.14.15.]有修改和额外的设计