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表1选择的伤口反应性deg，根据其推测的作用和表达谱聚类进行分组

来自:植物伤口木质部形成的转录组学分析松果体canariensis

集群 ID Seq。描述 H1 H2 H3
足球俱乐部 罗斯福 足球俱乐部 罗斯福 足球俱乐部 罗斯福
防御和应激反应基因
一个 Contig18804 抗病反应蛋白206样 395.78 0.00 37.14 0.00 52.52 0.00
一个 Contig19053 发病相关蛋白pr-4b样 96.55 0.00 23.91 0.00 19.77 0.00
一个 Contig22185 主要过敏原pru是1类 138.29 0.00 13.75 0.00 4.94 0.01
一个 Contig22375 发病相关蛋白pr-4样 343.24 0.00 7.69 0.00 7.38 0.00
一个 Ppnisotig12265 抗菌肽1样 72.52 0.00 16.88 0.00 12.84 0.00
一个 Ppnisotig13133 发病相关蛋白pr-4样 206.36 0.00 6.43 0.00 5.13 0.00
一个 Ppnisotig13431 抗病反应蛋白206样 133.78 0.00 24.75 0.00 31.68 0.00
B Contig00602 defensin ec-amp-d2-like 11.27 0.00 2.07 0.12 -1.42 0.65
B Contig02906 线虫抗性hspro2样 7.81 0.01 -1.23 0.94 -2.12 0.11
B Contig03079 乳谷胱甘肽裂解酶乙草醛酶I家族蛋白 3.96 0.04 1.97 0.20 -1.36 0.75
B Contig09180 硫氧还蛋白h形 6.82 0.01 1.52 0.44 1.39 0.55
B Contig19857 线虫抗性hspro2样 9.88 0.00 -1.33 0.83 -2.56 0.06
B Contig20555 苯丙氨酸ammonia-lyase-like 14.41 0.00 3.19 0.03 -1.08 1.11
C Contig13499 (-)-莰三环类氯塑料 2.17 0.17 2.14 0.12 2.81 0.01
D Contig00126 碱性几丁质酶a样 15.25 0.00 -1.20 0.55 0.34 1.13
D Contig10307 endochitinase像 65.05 0.00 3.40 0.02 1.49 0.47
D Contig17617 defensin ec-amp-d2-like 44.89 0.00 1.32 0.40 -1.23 0.69
D Contig21216 endochitinase像 92.45 0.00 2.28 0.08 2.51 0.02
D Contig23442 几丁质酶1 29.31 0.00 2.12 0.37 -1.65 0.41
D Ppnisotig00751 endochitinase pr4-like 85.39 0.00 3.16 0.02 1.28 0.78
D Ppnisotig01747 过氧化物酶12-like 97.76 0.00 1.74 0.28 1.53 0.37
D Ppnisotig06171 谷胱甘肽s转移酶f9样 41.49 0.00 2.48 0.05 1.55 0.36
D Ppnisotig08058 endochitinase pr4-like 89.60 0.00 1.15 1.04 1.12 1.08
H Contig03270 香叶基焦磷酸香叶基类叶绿体 1.61 0.46 1.48 0.45 2.57 0.03
H Contig08417 二萜二烯醇二萜二烯醛氧化酶样 1.10 1.12 2.08 0.11 2.64 0.02
H Ppnisotig10634 香叶基焦磷酸香叶基类叶绿体 -1.26 1.00 2.54 0.04 2.92 0.01
细胞壁基质发育和/或碳水化合物代谢
G Contig06476 caffeoyl——o-methyltransferase -1.27 0.97 -3.59 0.04 -1.44 0.61
G Contig15857 纤维素合酶样蛋白d3 1.38 0.78 -1.14 1.08 -3.00 0.04
G Contig17013 可能是木葡聚糖内转葡萄糖酶水解酶蛋白23 -1.24 0.93 -6.29 0.00 -7.64 0.00
G Contig21865 galactinol——蔗糖galactosyltransferase-like 2.27 0.18 -2.03 0.21 -3.39 0.03
H Contig00603 -木糖苷酶-l-阿拉伯糖糠糖苷酶2样 -0.57 1.10 2.46 0.07 2.58 0.03
H Contig03225 棒曲霉素α -2.10 0.20 2.64 0.04 1.99 0.13
H Contig05066 可能是果胶裂解酶15样 -5.21 0.01 2.08 0.20 3.24 0.01
H Contig05424 可能是木葡聚糖内转糖基化酶水解酶蛋白8样 -1.78 0.37 2.55 0.04 2.18 0.06
H Contig09907 可能是木葡聚糖内转葡萄糖基化酶水解酶蛋白32 -1.86 0.32 2.14 0.09 2.95 0.01
H Contig10173 内切葡聚糖酶24-like -3.26 0.05 1.58 0.46 2.58 0.03
H Contig13281 可能是果胶酯酶68样 -1.56 0.60 2.18 0.09 3.40 0.01
H Contig18777 内切葡聚糖酶24-like -1.69 0.41 2.54 0.04 5.32 0.00
H Contig18811 棒曲霉素α -1.59 0.58 3.42 0.01 4.98 0.00
我 Contig00766 木葡聚糖内转糖基化酶水解酶蛋白9样 -17.49 0.00 -1.36 0．72 -1.24 0.78
我 Contig02447 caffeoyl——o-methyltransferase-like -6.41 0.01 1.17 0.75 -1.58 0.34
我 Contig03231 可能是羧酸酯酶15样 -4.22 0.03 -1.63 0.38 -1.39 0.68
我 Contig08356 85年udp-glycosyltransferase a2-like -44.90 0.00 1.62 0.28 1.45 0.46
我 Contig11436 可能为聚半乳糖醛酸酶非催化亚基，类似jp650 -13.41 0.00 1.46 0.47 1.52 0.44
我 Contig13611 -木糖苷酶-l-阿拉伯糖糠糖苷酶2样 -4.92 0.02 0.35 1.08 1.39 0.56
我 Contig19457 木葡聚糖内转糖基化酶水解酶蛋白9样 -14.61 0.00 -1.41 0.66 -1.31 0.68
l Contig00654 纤维素合酶:催化亚基 -8.70 0.00 -1.86 0.26 -1.57 0.54
l Contig01405 蛋白质眼镜蛇式 -6.74 0.01 -2.06 0.20 -2.27 0.09
l Contig01916 木葡聚糖糖基转移酶4样 -1.45 0.71 -1.36 0.60 -4.36 0.01
激素信号
B Contig00715 1-aminocyclopropane-1-carboxylate oxidase-like 5.91 0.01 1.63 0.51 1.77 0.19
B Contig03482 水杨酸结合蛋白2样 5.92 0.01 1.99 0.14 1.40 0.57
C Contig00524 1-aminocyclopropane-1-carboxylate oxidase-like 1.69 0.38 3.80 0.02 2.65 0.02
C Ppnisotig12073 1-氨基环丙烷-1-羧酸氧化酶样异构体x1 3.27 0.05 2.48 0.05 2.29 0.04
D Contig14053 水杨酸结合蛋白2样 22.28 0.00 3.04 0.04 3.76 0.00
我 Contig16100 1-aminocyclopropane-1-carboxylate氧化酶 -4.81 0.02 2.54 0.04 2.45 0.04
分生组织活性的转录调控
B Contig00787 含Nac结构域的2样蛋白 9.26 0.00 -1.02 0.85 -1.26 0.79
B Contig12353 早期结节样蛋白 9.58 0.00 -1.48 0.61 -2.80 0.05
B Contig20304 同源箱亮氨酸拉链蛋白athb-13样 3.82 0.04 1.31 0．72 1.24 0.86
D Contig13895 Nac转录因子29样 22.81 0.00 1.08 1.07 1.20 0.64
G Contig09007 《驱魔2》 -0.36 1.17 -3.66 0.03 -4.59 0.01
H Contig06813 wuschel相关homeobox 4-like -1.76 0.34 1.49 0.47 2.61 0.02
H Contig14178 Clavata3 esr相关12家族蛋白 -3.46 0.05 1.70 0.41 2.45 0.03
l Contig05551 可能是转录因子51样 -2.28 0.19 -3.39 0.04 -2.23 0.15
l Contig12050 转录因子myb46样 -9.05 0.00 -2.05 0.18 -2.11 0.22
未注释的基因和未知的功能
一个 Contig03506 假设蛋白SELMODRAFT_115352 63.88 0.00 20.85 0.00 12.74 0.00
B Contig09209 - NA - 13.90 0.00 1.35 0.82 -1.67 0.36
B Contig22448 - NA - 12.00 0.00 1.31 0.68 -1.40 0.64
B Contig24621 - NA - 12.34 0.00 0.36 1.01 -1.81 0.30
D Contig19474 - NA - 22.81 0.00 1.49 0.64 0.36 1.09
D Contig20761 预测蛋白质 24.06 0.00 1.29 0.75 1.80 0.20
D Contig22397 - NA - 31.25 0.00 2.29 0.09 1.10 1.10
D Contig23569 - NA - 36.23 0.00 2.55 0.06 -2.05 0.27
F Contig03012 - NA - 7.04 0.01 -7.98 0.00 -4.60 0.01
F Contig03111 - NA - 5.57 0.02 -3.12 0.12 -2.77 0.05
G Contig12685 但一个个loc101213469 1.34 0.82 -1.79 0.31 -6.43 0.00
G Contig20076 - NA - 2.71 0.12 0.11 1.03 -7.76 0.00
G Contig23934 - NA - 1.31 0.79 -2.74 0.08 -9.51 0.00
G Contig24690 - NA - 1.55 0.53 -2.30 0.17 -8.11 0.00
H Contig12627 - NA - -1.94 0.28 4.42 0.00 8.62 0.00
H Contig21346 - NA - -1.02 1.19 7.69 0.00 7.90 0.00
我 Contig02729 - NA - -11.85 0.00 2.03 0.19 1.70 0.23
我 Contig13781 - NA - -12.25 0.00 -1.08 1.01 1.09 0.88
我 Contig16419 - NA - -13.45 0.00 1.55 0.31 -0.45 0.83
我 Contig19504 - NA - -12.31 0.00 -1.05 1.03 1.13 0.90
l Contig02798 但一个个loc101210414 -1.25 0.99 -1.78 0.29 -5.06 0.01
l Contig10360 - NA - -9.23 0.00 -2.42 0.12 -1.69 0.36
l Contig12514 - NA - -9.36 0.00 -2.14 0.17 -1.35 0.33
l Contig14134 - NA - -1.64 0.55 -9.50 0.00 -3.12 0.04
l Contig14477 - NA - -10.08 0.00 -2.38 0.12 -2.15 0.12
l Contig20478 - NA - -1.33 0.86 -5.43 0.01 -2.76 0.04
l Contig34794 预测:未表征蛋白LOC101509257 -10.94 0.00 -3.20 0.04 -2.59 0.10
  1. 舰队指挥官:叠化。FDR:根据错误发现率调整p值。黑体表示有统计学意义的值
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BMC植物生物学

ISSN: 1471 - 2229

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