基因座 | 等位基因 | 监管区域的地位/变化 | 倍性,基因组,物种的水平 | 参考 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
启动子 | 第一个内含子 | 2n. | 4N. | 6N. | ||||
BBAA. | GGAA. | BBAADD. | ||||||
VRN-A1 | VRN-A1 | VRN-A1/ 8 BP插入与VRN-A1或者VRN-A1所有二倍体 | VRN-A1/没有变化 | Dicoccoides. T. dicoccum. T. Durum. |
T. Aestivum. | [21.那22.那26.那27.那29.那56.] | ||
VRN-A1U | VRN-A1U/ snps与VRN-A1或者VRN-A1其他二倍体 | VRN-A1U/ 1.4 kB删除与VRN-A1或者VRN-A1其他二倍体 | T. Uraartu.(AA) | [27.] | ||||
VRN-A1F. | VRN-A1F./ 50 bp删除与VRN-A1 | VRN-A1/在某些情况下发现大型诱惑(见下文) | T. Araraticum,T. Timopheevii | [26.49] | ||||
VRN-A1F-Del | VRN-A1F./ 50 bp删除 | VRN-A1F-DEL /2.7 KB删除 | araraticum | [49.] | ||||
VRN-A1F-INS | VRN-A1F./ 50 bp删除 | VRN-A1F-INS /0.4 kB插入 | T. Timopheevii. | [49.] | ||||
VRN-A1F-DEL / INS | VRN-A1F./ 50 bp删除 | VRN-A1F-DEL / INS /0.4 kB插入,2.7 kB删除 | T. Timopheevii. | [49.] | ||||
VRN-A1A | VRN-A1A.1-A.3/ 231或211或52 BP插入 | VRN-A1/没有变化 | T. dicoccum. T. Durum. |
T. Aestivum. | [21.那26.那29.那56.] | |||
VRN-A1B. | VRN-A1B./ 19 BP删除 | VRN-A1/没有变化 | Dicoccoides. T. dicoccum. T. Durum. |
T. Aestivum. | [21.那26.那27.那29.那56.] | |||
VRN-A1C. | VRN-A1/没有变化 | VRN-A1C./ 5.5 KB删除 | T. Turgidum. | T. Aestivum. | [3.那21.] | |||
VRN-A1D | VRN-A1D/ 19和32 bp删除 | VRN-A1/没有变化 | Dicoccoides. | [21.那26.那27.] | ||||
VRN-A1E | VRN-A1E/ 54 BP删除 | VRN-A1/没有变化 | T. dicoccum. T. Durum. |
[21.那26.那29.] | ||||
VRN-A1F1. | VRN-A1F1./ 1 bp删除 | VRN-A1/没有变化或VRN-A1ins. | T. Monococcum.(AA) | [25.那27.] | ||||
VRN-A1ins. | VRN-A1/没有变化或VRN-A1F1. | VRN-A1ins./ 0.5 kB插入 | T. Monococcum.(AA) | [25.那27.] | ||||
VRN-A1G. | VRN-A1G./ 34 BP删除 | VRN-A1/没有变化 | T. Monococcum.那T.Booticum.(AA) | [26.] | ||||
VRN-A1H. | VRN-A1H./ 20 bp删除 | VRN-A1/没有变化 | T.Booticum.(AA) | [27.] | ||||
VRN-A1I. | VRN-A1I./ SNP. | VRN-A1/没有变化 | T. Durum. | [29.那56.] | ||||
VRN-A1K. | VRN-A1K./ 42 BP插入 | VRN-A1/没有变化 | T. Durum. | KX874608. | ||||
VRN-A1L. | VRN-A1/没有变化 | VRN-A1L./ 7.2 KB删除 | Dicoccoides. T. carthlicum, T. Polonicum. T. Durum. |
[22.那27.] | ||||
VRN-B1 / G1 | VRN-B1 | VRN-B1/没有变化 | VRN-B1/没有变化 | Dicoccoides. T. dicoccum. T. Durum. |
T. Aestivum. | [21.那22.那26.那27.那29.那56.] | ||
VRN-B1SP. | VRN-B1SP./微小的变化与VRN-B1 | VRN-B1SP./没有大的变化 | AE。Spottoides.(BB / GG) | [27.] | ||||
VRN-B1DIC. | VRN-B1DIC./ 11%异化与VRN-B1 | VRN-B1/没有变化 | Dicoccoides. | [28.] | ||||
VRN-B1A. | VRN-B1/没有变化 | VRN-B1A./ 6.8 KB删除 | T. Durum. | T. Aestivum. | [22.那29.那56.] | |||
VRN-B1B. | VRN-B1/没有变化 | VRN-B1B./VRN-B1A.+另外36 bp删除和snp | T. Aestivum. | [57.那58.] | ||||
VRN-B1C. | VRN-B1/没有变化 | VRN-B1C./ 7.6 kB删除,0.4 kB复制 | T. Durum. | T. Spelta. T. Aestivum. |
[34.那58.那56.] | |||
VRN-B1ins. | VRN-B1ins./ 5.4 kB插入 | VRN-B1/没有变化 | T. Carthlicum. | [53.] | ||||
VRN-B1A. | VRN-B1A./ 127 BP插入 | VRN-B1/没有变化 | T. Turanicum. | [26.] | ||||
VRN-G1A. | VRN-G1A./ 220 BP插入 | VRN-B1/没有变化 | araraticum, T. Timopheevii. |
[26.那49.] | ||||
VRN-D1 | VRN-D1 | VRN-D1/没有变化 | VRN-D1/没有变化 | AE。Tauschii.(DD) | T. Aestivum. | [21.那22.那29.] | ||
VRN-D1A | VRN-D1/没有变化 | VRN-D1A/ 4.2 KB删除 | T. Aestivum. | [22.] | ||||
VRN-D1B. | VRN-D1B./ SNP. | VRN-D1A/ 4.2 KB删除 | T. Aestivum. | [63.] | ||||
VRN-D1с. | VRN-D1с./ 174 BP插入 | VRN-D1/没有变化 | T. Aestivum. | [64.] | ||||
VRN-D1s. | VRN-D1/没有变化 | VRN-D1s./ 0.8 kB插入 | T. Aestivum. | [65.] | ||||
VRN-D(t)1 | VRN-D1/没有变化 | VRN-D(t)1/ 5.4 kB删除 | AE。Tauschii.(DD) | [50.] |