跳到主要内容

表1启动子区的等位基因变异性和第一内含子VRN1.小麦基因

从:进化VRN-1Allopolyploids中的同种源位点托管及其二倍体前体

基因座 等位基因 监管区域的地位/变化 倍性,基因组,物种的水平 参考
启动子 第一个内含子 2n. 4N. 6N.
BBAA. GGAA. BBAADD.
VRN-A1 VRN-A1 VRN-A1/ 8 BP插入与VRN-A1或者VRN-A1所有二倍体 VRN-A1/没有变化 Dicoccoides.
T. dicoccum.
T. Durum.
T. Aestivum. [21.22.26.27.29.56.]
VRN-A1U VRN-A1U/ snps与VRN-A1或者VRN-A1其他二倍体 VRN-A1U/ 1.4 kB删除与VRN-A1或者VRN-A1其他二倍体 T. Uraartu.(AA) [27.]
VRN-A1F. VRN-A1F./ 50 bp删除与VRN-A1 VRN-A1/在某些情况下发现大型诱惑(见下文) T. Araraticum,T. Timopheevii [26.49]
VRN-A1F-Del VRN-A1F./ 50 bp删除 VRN-A1F-DEL /2.7 KB删除 araraticum [49.]
VRN-A1F-INS VRN-A1F./ 50 bp删除 VRN-A1F-INS /0.4 kB插入 T. Timopheevii. [49.]
VRN-A1F-DEL / INS VRN-A1F./ 50 bp删除 VRN-A1F-DEL / INS /0.4 kB插入,2.7 kB删除 T. Timopheevii. [49.]
VRN-A1A VRN-A1A.1-A.3/ 231或211或52 BP插入 VRN-A1/没有变化 T. dicoccum.
T. Durum.
T. Aestivum. [21.26.29.56.]
VRN-A1B. VRN-A1B./ 19 BP删除 VRN-A1/没有变化 Dicoccoides.
T. dicoccum.
T. Durum.
T. Aestivum. [21.26.27.29.56.]
VRN-A1C. VRN-A1/没有变化 VRN-A1C./ 5.5 KB删除 T. Turgidum. T. Aestivum. [3.21.]
VRN-A1D VRN-A1D/ 19和32 bp删除 VRN-A1/没有变化 Dicoccoides. [21.26.27.]
VRN-A1E VRN-A1E/ 54 BP删除 VRN-A1/没有变化 T. dicoccum.
T. Durum.
[21.26.29.]
VRN-A1F1. VRN-A1F1./ 1 bp删除 VRN-A1/没有变化或VRN-A1ins. T. Monococcum.(AA) [25.27.]
VRN-A1ins. VRN-A1/没有变化或VRN-A1F1. VRN-A1ins./ 0.5 kB插入 T. Monococcum.(AA) [25.27.]
VRN-A1G. VRN-A1G./ 34 BP删除 VRN-A1/没有变化 T. Monococcum.T.Booticum.(AA) [26.]
VRN-A1H. VRN-A1H./ 20 bp删除 VRN-A1/没有变化 T.Booticum.(AA) [27.]
VRN-A1I. VRN-A1I./ SNP. VRN-A1/没有变化 T. Durum. [29.56.]
VRN-A1K. VRN-A1K./ 42 BP插入 VRN-A1/没有变化 T. Durum. KX874608.
VRN-A1L. VRN-A1/没有变化 VRN-A1L./ 7.2 KB删除 Dicoccoides.
T. carthlicum,
T. Polonicum.
T. Durum.
[22.27.]
VRN-B1 / G1 VRN-B1 VRN-B1/没有变化 VRN-B1/没有变化 Dicoccoides.
T. dicoccum.
T. Durum.
T. Aestivum. [21.22.26.27.29.56.]
VRN-B1SP. VRN-B1SP./微小的变化与VRN-B1 VRN-B1SP./没有大的变化 AE。Spottoides.(BB / GG) [27.]
VRN-B1DIC. VRN-B1DIC./ 11%异化与VRN-B1 VRN-B1/没有变化 Dicoccoides. [28.]
VRN-B1A. VRN-B1/没有变化 VRN-B1A./ 6.8 KB删除 T. Durum. T. Aestivum. [22.29.56.]
VRN-B1B. VRN-B1/没有变化 VRN-B1B./VRN-B1A.+另外36 bp删除和snp T. Aestivum. [57.58.]
VRN-B1C. VRN-B1/没有变化 VRN-B1C./ 7.6 kB删除,0.4 kB复制 T. Durum. T. Spelta.
T. Aestivum.
[34.58.56.]
VRN-B1ins. VRN-B1ins./ 5.4 kB插入 VRN-B1/没有变化 T. Carthlicum. [53.]
VRN-B1A. VRN-B1A./ 127 BP插入 VRN-B1/没有变化 T. Turanicum. [26.]
VRN-G1A. VRN-G1A./ 220 BP插入 VRN-B1/没有变化 araraticum,
T. Timopheevii.
[26.49.]
VRN-D1 VRN-D1 VRN-D1/没有变化 VRN-D1/没有变化 AE。Tauschii.(DD) T. Aestivum. [21.22.29.]
VRN-D1A VRN-D1/没有变化 VRN-D1A/ 4.2 KB删除 T. Aestivum. [22.]
VRN-D1B. VRN-D1B./ SNP. VRN-D1A/ 4.2 KB删除 T. Aestivum. [63.]
VRN-D1с. VRN-D1с./ 174 BP插入 VRN-D1/没有变化 T. Aestivum. [64.]
VRN-D1s. VRN-D1/没有变化 VRN-D1s./ 0.8 kB插入 T. Aestivum. [65.]
VRN-D(t)1 VRN-D1/没有变化 VRN-D(t)1/ 5.4 kB删除 AE。Tauschii.(DD) [50.]