BGRS \ SB-2016的计算植物生物科学：介绍性票据

在这一特别问题中，我们在基因组调控和系统生物学（BGRS \ SB）多会议上提供的材料呈现材料（http://conf.bionet.nsc.ru/bgrssb2016)以及早期的植物遗传学和基因组学研讨会(http://conf.bionet.nsc.ru/plant-food/).

BGRS \ SB'2016举行2016年8月29日 - 2016年9月2日在俄罗斯新西伯利亚，以及系统生物学和生物信息学的年轻科学家学校（SBB）（SBB）（http://conf.bionet.nsc.ru/sbb2016/en/). BGRS生物信息学系列会议由N.A.Kolchanov院士发起，在1998年第一次规模相对较小的国际会议之后，BGRS/SB由俄罗斯科学院西伯利亚分院细胞学和遗传学研究所（ICG SB RAS）在新西伯利亚阿卡德姆戈罗多克每半年举行一次。2016年是BGRS系列十周年；今年，来自不同国家的500多名与会者参加了这次会议，其中包括几次涉及系统生物学主题的专题讨论会。BGRS\SB-2016会议记录的全部内容，以及所有讲座、口头报告和海报的摘要，包括“植物生物信息学和系统生物学”部分的内容，可在http://www.bionet.nsc.ru/files/2016/conference/BGRS2016.pdf.

在过去的二十年中，BGRS / SB系列将在跨学科系统生物领域工作的生物学家，计算机科学家，物理学家，数学家和生物化学家的主要会议场地。现在关注计算植物生物学。本节致力于分析基因组结构和功能组织的基因组和后基因组方法，以及对植物系统生物学的纳入知识的整合。

植物遗传学研究的一个关键目标是寻找有助于培育新的高效品种具有对最终产品质量影响的特征的基础知识。在这一重要的学习途径中，这一特别问题始于调查小麦遗传学的两篇文章，世界上最重要的食物股之一[1那2]。两者都是作品的功能VRN1.（vernalization）基因。Irina Konopatskaia和同事的论文“VRN1.具有春季生长习性的四倍体小麦品种的基因变异”考虑228个四倍体小麦品种的生长习性和VRN1.基因[1]. 在“四倍体Timopheevi小麦春季形态的发生与该基因第一内含子的变异有关VRN-A1基因，“Shcherban和合着者讨论了启动子区域VRN-A1基因araraticum.和T提摩菲四倍体物种[2]。另一个文章在这个问题中的六倍面包小麦的分析（Triticum aestivum L.。，aabbdd）[3.] - 另一种具有重要农业价值的小麦种类。

Shmakov等人。“鉴定RNA-SEQ核基因控制大麦叶绿素合成”[4.使用转录物测序以鉴定负责大麦中叶绿素合成的基因，另一个重要的作物植物。

dmitriev等人的工作。“亚麻的基因表达谱分析（Linum Usitatissimum.L.）在拭子应激下“[5.]在亚麻中表达基因。栽培亚麻(Linum Usitatissimum.L.）广泛用于生产纺织，食品，化学品和药品。亚麻植物转录组的高通量测序在应力条件下允许鉴定在磷酸盐缺乏和过量的营养条件下差异表达的基因。

Sugawara等人的论文。“细胞外核糖核酸酶基因的表达增加了烟草中黄瓜叶片病毒的抗性”[6.[烟草模型实例的植物防御对抗病原体。作者证明了升高的细胞外rNase活性水平导致抗性增加黄瓜马赛克病毒在烟草植物中。

通过Ravin和同事工作，“非光合肌营养营养不良癖的塑性和核基因组中的光合途径失去单调的低估，” [7.[呈对属于家庭的纯肌营养植物的体积基因组ericaceae.。使用基因组测序作者发现了M垂体质体基因组是专性非光合寄生物种最具功能还原特征的基因组之一。

最后，我们必须承认一些支持BGRS会议系列和植物生物学研究的组织：细胞学和遗传学研究所SB RAS（www.bionet.nsc.ru/新西伯利亚州立大学（www.nsu.ru/），科学组织联邦机构（FANO.GOV.RU），俄罗斯科学院的西伯利亚分公司（http://www.sbras.ru/en/）遗传学家和育种者的Vavilov社会（http://www.bionet.nsc.ru/vogis/;http://vogis.org/).

这一系列的植物生物学会议将在未来几年继续举行——我们很高兴宣布在哈萨克斯坦召开PlantGen-2017会议(http://primerdigital.com/PlantGen2017/en/)以及在新西伯利亚举行的BGRS\SB-2018会议。我们欢迎所有读者参加这些会议。

总体而言，这种关于植物生物学研究的主题问题延续了先前BMC系列补充问题植物系统生物学研究的传统//www.cinefiend.com/articles/supplements/volume-16- supplement-1.. 我们还想提及我们正在与BioMed Central就全文主题问题进行的合作，这些主题反映了本系列会议的研究里程碑。过去，BioMed Central出版了几期特刊，重点介绍了在BGRS会议上提交的材料，包括BMC基因组学问题(http://www.biomedcentral.com/bmcgenomics/supplements/15/S12)，BMC进化生物学(http://www.biomedcentral.com/bmcevolbiol/supplements/15/S1），BMC遗传学（http://www.biomedcentral.com/bmcgenet/supplements/16/S1)和BMC系统生物学(http://www.biomedcentral.com/bmcsystbiol/supplements/9/S2)，另见SBB问题[8.]。来自BGRS \ SB-2016的其他论文包含在BMC系列期刊的补充问题中，即BMC植物生物学，BMC基因组学，BMC遗传学，BMC系统生物学和BMC生物信息学。

此外，在生物信息学和计算生物学杂志上公布了生物信息学的特殊问题（http://www.worldscientific.com/toc/jbcb/13/01）[9.]和《瓦维洛夫选择与育种杂志》(http://www.bionet.nsc.ru/vogis/2014-year/18-4-2/)（俄语）。在新西伯利亚举行的植物生物学会议是PlantGen系列会议的一部分，也在生物医学中心主题议题中介绍//www.cinefiend.com/articles/supplements/volume-16- supplement-1.。BGRS会议活动和植物遗传研讨会的材料在“Vavilov Chinusse和繁殖”的特刊上​​发表http://www.bionet.nsc.ru/vogis/2014-year/18-4-1/. 第三届国际会议“植物遗传学、基因组学、生物信息学和生物技术”的会议记录也可查阅(http://csl.isc.irk.ru/BD/Books/Plant%20genetics.pdf).