发现由给定细胞类型表达的特征蛋白质以及这些蛋白质在开发或病理过程中如何变化,最近仅可行。强大的分离技术与质谱和质谱法的灵敏度和选择性联系,用于鉴定这些蛋白质。基于计算机的生物信息学技术用于将独特的肽与基因组匹配。
我们最近从国家科学基金会(美国)获得了一个主要的研究仪表奖,以获得新的最先进的蛋白质分析设备。具体地,我们已经获得了与毛细管液相色谱仪(CAP-LC)接口的研究级杂交四溴肟氧化物ESI-MS / MS质谱仪。该系统(Micromass V-QTM)是一种敏感(Femtomole),高分辨率,飞行质谱仪(TOF)的时间,具有电喷雾电离(ESI)样品引入接口,用于CAPLC。
串联四溴质谱能力和高分辨率允许测定肽的氨基酸序列。与光谱仪相关联的软件用于未在相同肽和蛋白质的上食,驱动LC分离,并处理数据分析中的其他预期并发症。
作为本提案的一部分,我们收到了为教育工作者开发教育和外展模块的资金。该提出的模块涉及对植物中细胞死亡进行研究进行的基于蛋白质组学的实验。黄花菜(Hemerocallis.SPP。)为植物中的非应力相关编程细胞死亡提供了理想的模型系统。整个遗传程序/级联在紧凑的24-H周期发生,并且可以在一系列特定的顺序步骤中进行。我们目前正在分析在12小时的细胞死亡的各个阶段在开花开口之前开始的各个阶段的变化,并且在开放后12小时的最终阶段结束。目前正在利用霰弹枪蛋白质组学方法。源自本研究的数据不仅可以在植物中提供有价值的洞察力,而且还用于教授蛋白质组学和对参与生物指导的教育工作者的生物过程研究。
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Tomkins,J.P.,Powell,G.&Wu,Y.涉及编程细胞死亡的蛋白质分析Hemerocallis.花瓣。BMC植物BIOL.5,S31(2005)。https://doi.org/10.1186/1471-2229-5-S1-S31
关键词
- 程序细胞死亡
- 独特的肽
- 黄花菜花
- 强大的分离
- 霰弹枪蛋白质组